Teknolojilerin kesiştiği nokta!

Veri görselleştirmeyle kanser tedavisi

Herkes Hollanda Kanser Enstitüsü’nün oniki yıllık göğüs kanseri veritabanının eskimeye yüz tutmuş bir haber olduğunu düşünmüştü. Ta ki araştırmacı Pek Lum ve Merck & Co firması veritabanını İlingesel Veri İnceleme-İVİ (Topological Data Analysis- TDA) ve gelişmiş makine öğrenme teknolojisini kullanarak veriyi görsel hale getirip inceleyene kadar. Bu inceleme onu Wall Street Journal’da yayınlanan bir hikâyenin kahramanı yaptı. Bundan daha da önemlisi, önceki araştırmalarda bulunamamış, göğüs kanserinden kurtulan ve benzer davranışlar gösteren bir grubu tespit etmesini ve tedavinin bulunmasında bir adım daha atılmasını sağladı.

Pek’in deneyi onu, buluşu için hayati önem taşıyan yazılımı geliştiren Ayasdi firmasının baş veri araştırmacısı konumuna getirdi. Ayasdi yazılımı Pek’in, İVİ’yi kullanarak kanser veritabanından otomatik bir ilingesel ağ oluşturabilmesine olanak sağladı. İVİ, İlinge (Topoloji) olarak bilinen bir matematik dalından yararlanılarak oluşturulmuştur. Aşırı karmaşık veritabanları içindeki benzerlikleri bulmak için kullanılarak, oluşturulan şekil sayesinde uzmanlara araştırmalarında yeni bakış açıları kazandırabilir.

Daha geleneksel bir yöntem olan verinin bir kısmına belirli sorular sormak yerine, Pek veriyi bir bütün olarak görebildi ve verinin kendisini ifade etmesini sağladı. Pek göğüs kanseri veri tabanını, hastaların genetik yapıları temelinde noktalar oluşturması için Ayasdi yazılımına yükledi. Yazılım daha sonra aynı hastanın içinde olduğu iki ya da daha fazla noktayı çizgilerle birleştirdi. Sonuçta bu işlem verinin içindeki ilişkileri kullanarak oldukça karmaşık bir venn çizeneği yarattı. Oluşturulan ilingesel ağ sayesinde kanserden kurtulanların alt grupları ortaya çıktı ve hangi özelliğin bu grubu eşsiz yaptığı belirlendi.

İVİ, dünya üzerindeki alan uzmanlarının ellerindeki verilere bakışını değiştirdi ve aşırı karmaşık veri tabanlarının otomatik olarak incelenebilmesi için uyumlu olarak kullanılabilecek birçok algoritma içeren yeni bir çerçeve sundu. Daha da önemlisi makine mühendislerine, finansal incelemecilere, pazarlamacılara ve onkologlara ellerinde verileri görselleştirerek yeni buluşlara kapı açabilme olanağı sundu.

Kaynak: http://java.dzone.com



Sizi Arayalım!
Sitemizi kullanarak çerezlere (cookie) izin vermektesiniz. Detaylı bilgi için Çerez Politika'mızı inceleyebilirsiniz.